Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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