Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3CQ99985 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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