Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF3C6Q969F1 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms