Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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VPS72Q15906 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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