Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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SYCP1Q15431 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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