Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ACACAQ13085 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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