Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms