Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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