Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms