Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
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SS18Q15532 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SS18Q15532 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SS18Q15532 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SS18Q15532 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SS18Q15532 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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SS18Q15532 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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SS18Q15532 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SS18Q15532 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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