Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GRIK2Q13002 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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