Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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CCDC173Q0VFZ6 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC173Q0VFZ6 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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