Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms