Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms