Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms