Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms