Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms