Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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