Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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