Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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