Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms