Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C17orf47Q8NEP4 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms