Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 OR5G5P-204ENST00000627642 621 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP6V1FQ16864 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms