Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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