Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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