Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TMPOP42166 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TMPOP42166 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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