Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms