Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC006978.2-201ENST00000442800 666 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PDGFDQ9GZP0 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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