Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms