Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms