Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms