Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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CUL4AQ13619 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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CUL4AQ13619 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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CUL4AQ13619 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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CUL4AQ13619 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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