Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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