Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms