Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
C16orf54Q6UWD8 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
C16orf54Q6UWD8 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms