Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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