Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FXNQ16595 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms