Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
R3HDM1Q15032 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms