Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ZBED1O96006 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms