Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC021106.2-201ENST00000505310 710 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC093281.1-201ENST00000514239 549 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 WARSP1-201ENST00000533936 454 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC243972.1-201ENST00000542992 570 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL022324.3-201ENST00000609330 747 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CT45A8-202ENST00000611660 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CT45A2-202ENST00000612907 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CRYGA-201ENST00000304502 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 C14orf177-201ENST00000325812 1284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC019077.1-201ENST00000356499 397 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RN7SKP72-201ENST00000362327 292 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC092568.1-201ENST00000440950 1284 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SAP18P3-201ENST00000449663 396 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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