Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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