Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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