Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms