Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TTF2Q9UNY4 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms