Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms