Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms