Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NDUFA9Q16795 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms