Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SIX1Q15475 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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SIX1Q15475 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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SIX1Q15475 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SIX1Q15475 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SIX1Q15475 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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SIX1Q15475 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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