Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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