Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
DUSP4Q13115 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms